日本鬣羚在富士-丹沢山地区的出没地点
及其生境因子数据集内容与研发

土光智子*,陈文波

日本庆应义塾大学SFC研究所,藤泽 2520882

摘 要:日本鬣羚(Naemorhedus crispus)是日本特有和稀有哺乳动物物种,被誉为日本自然遗迹。作者在日本富士-丹沢地区共采集到319个地点的记录,其中160个是日本鬣羚的出现地点,其余159个地点没有日本鬣羚出现。每一个记录点均采集了14个与日本鬣羚生存相关的生境因子。在该数据集的基础上,作者于2013年发表了一篇题目为“The geographical distribution and habitat use of Japanese serow (Naemorhedus crispus) in the Fuji-Tanzawa region, Japan”的论文(Journal of Environmental Information Science, 41: 53-62)。土光智子的硕士学位论文“Modeling of species geographic distribution for assessing present needs for the ecological networks: case study of Fuji region and Tanzawa region, Japan”(2007)的部分结论也是基于此项调查的部分内容。日本鬣羚的生境因子包括海拔高度、坡度、年降水量、年最高气温、年最低气温、到河流的距离、到所有道路的距离、到高速公路的距离、到普通道路的距离、到小路和石砌台阶的距离、到宽路(路宽超过13 m)的距离、到窄路(路宽在13 m以内,含13 m)的距离、NDVI(归一化植被指数)和植物群落(一级分类)的植被覆盖类型。数据集的格式是CSV格式(.csv)、Google Earth格式(.kmz)和Arc/Info格式(.shp)。投影基准面是日本大地基准面2000。用于生成这个数据集的栅格数据的空间分辨率是50 m,数据量321 KB。

关键词:日本鬣羚;富士-丹沢地区;物种出没记录;生境因子;日本

DOI: https://doi.org/10.3974/geodp.2017.01.15

1 前言

日本鬣羚(Naemorhedus crispus)是一种日本特有和稀有的哺乳动物(见图1)。它主要分布在日本本州、四国、九州的山区[1]。以前人们为了吃肉,或者获得皮毛,曾经过度捕猎日本鬣羚,以至日本鬣羚的数量大量减少。1934年,日本政府宣布日本鬣羚为国宝[2],并称它为日本宝贵的自然遗迹。此后,日本政府为保护日本鬣羚制定国家政策和保护措施,日本鬣羚的种群数量有所恢复[2]

日本鬣羚邮票、日本鬣羚及其食物与生境

图1 日本鬣羚
A. 日本政府通过各种渠道呼吁国民保护日本鬣羚,图为1952年日本邮政发行的日本鬣羚邮票
B. 日本鬣羚[3](长约80 cm,重约35 kg[4]
C. 日本鬣羚的食物及其生境[3]

下载

作者一共采集到319个地点的记录,其中160个是日本鬣羚的出现地点,其余159个地点没有日本鬣羚出现。每一个记录点均采集了14个与日本鬣羚生存相关的生境因子。在该数据集基础上,Doko和Chen发表了一篇题目为“The geographical distribution and habitat use of Japanese serow (Naemorhedus crispus) in the Fuji-Tanzawa region, Japan”的论文[1]。 Doko, T.的硕士学位论文“Modeling of species geographic distribution for assessing present needs for the ecological networks: case study of Fuji region and Tanzawa region, Japan” (2007)[5]的部分结论也是基于此项调查的部分内容。

2 数据集元数据简介

日本鬣羚在日本富士-丹沢地区的出没地点及其生境因子数据集[6]的元数据简介见表1

表1 日本鬣羚在日本富士-丹沢地区的出没地点及其生境因子数据集的元数据简表
条目描述
数据集名称日本鬣羚在日本富士-丹沢地区的出没地点及其生境因子数据集
数据集短名JpSerow_env_FT
作者信息土光智子L-6494-2016, 日本庆应义塾大学SFC研究所, dokochan@sfc.keio.ac.jp
陈文波L-5715-2016, 日本庆应义塾大学SFC研究所, chenwb3@gmail.com
地理区域35°10'-35°40' N,138°30'-139°20' E 投影及数据标准 日本大地基准面2000
数据年代2013 空间分辨率 50 m
数据格式点数据,有CSV格式(.csv)、Google Earth格式(.kmz)和Arc/Info格式(.shp)
数据量原始数据321 KB,压缩后为103 KB
数据集组成本数据集共包括3个数据文件:
(1)Google Earth格式:dataset_serow_jgd2000.kmz,29 KB
(2)表格格式:dataset_serow_jgd2000.csv,43 KB
(3)GIS矢量数据.shp格式:dataset_serow_jgd2000_shape.zip,249 KB
基金项目荷兰国际地球信息科学与地球观测研究所、日本科学促进会2012年伙伴基金补助项目(KAKENHI No.23-4520);日本庆应义塾大学国际环境创新计划(日本教育文化体育科学与技术部,科学与技术促进策略基金)
出版与共享服务平台全球变化科学研究数据出版系统 http://www.geodoi.ac.cn
地址北京市朝阳区大屯路甲11号100101,中国科学院地理科学与资源研究所
数据共享政策全球变化科学研究数据出版系统的“数据”包括元数据(中英文)、实体数据(中英文)和通过《全球变化数据学报》(中英文)发表的数据论文。其共享政策如下:(1)“数据”以最便利的方式通过互联网系统免费向全社会开放,用户免费浏览、免费下载;(2)最终用户使用“数据”需要按照引用格式在参考文献或适当的位置标注数据来源;(3)增值服务用户或以任何形式散发和传播(包括通过计算机服务器)“数据”的用户需要与《全球变化数据学报》(中英文)编辑部签署书面协议,获得许可;(4)摘取“数据”中的部分记录创作新数据的作者需要遵循10%引用原则,即从本数据集中摘取的数据记录少于新数据集总记录量的10%,同时需要对摘取的数据记录标注数据来源[7]

3 数据集研发方法

有关数据集获取的详细描述可以从作者在2013年发表的“The geographical distribution and habitat use of Japanese serow (Naemorhedus crispus) in the Fuji-Tanzawa region, Japan”[1]的论文,以及Doko T.的硕士论文[5]中查到。本文中,我们只对数据集的获取方法做概要介绍。

3.1 研究区域

研究区域位于日本的富士和丹沢地区,地理位置为35°10'N-35°40'N,138°30'E-139°20'E(日本大地基准面2000)(图2)。研究区域属于山区,包括富士山国家公园和丹沢山自然公园。这些公园境内包含多种景观类型,生物多样性很丰富,区域内有许多日本特有物种[1,8]

日本富士-丹沢地区遥感影像立体示意图

图2 日本富士-丹沢地区遥感影像立体示意图[9](红圈显示的是研究区域的大致范围)

下载

3.2 观测点记录的获取

首先,在一幅丹沢山地区图上标注出160个日本鬣羚出现地点的位置图[3]。这幅图是根据调查问卷和访谈制作的。调查问卷和访谈的主要对象是1993-1996年对丹沢山区进行研究的调查人员(57人)、当地公园的导游(100人)、自然保护组织的成员(32人)和登山协会会员(72组)等[3]。这些被调查和访谈的对象对日本鬣羚在丹沢区域的主要活动地点比较了解。这个调查的目的是采集日本鬣羚栖息在丹沢地区被观测到的信息[3]。这幅图的范围包括了丹沢山的整个地区。

其次,将地图进行数字化几何校正,使其带有坐标信息。由于地图中有河流的位置信息,作者根据河流就能很容易地选择地面控制点,然后运用1阶多项式仿射变换,对扫描的地图进行校正。相应的均方根误差是251 m。基于校正的图象,将160个点进行手工数字化。地理坐标在ArcMap中自动计算生成。

由于缺乏日本鬣羚没有在某地出现的精确数据,作者所采取的日本鬣羚没有出现的数据是采用土光智子的方法论[8]并从日本哺乳动物全国分布图中的文献[10]中获得。一共生成了160个没有出现点。日本哺乳动物全国分布图由5 km×5 km的格网组成。然而,本文所用的方法是在1978-2003年之间没有观测到日本鬣羚的多边形内进行随机选点,而不是直接用网格。因此,没有出现点的空间分辨率与出现点的分辨率大致相同。

3.3 生境因子数据库

根据日本鬣羚的生态学知识[3,11–13],选择了可能影响鬣羚分布的生境因子:海拔高度、地形坡度、年降水量、年最高气温、年最低气温、到河流的距离、到所有道路的距离、到高速公路的距离、到普通道路的距离、到小路和石砌台阶的距离、到宽路(路宽超过13 m)的距离、到窄路(路宽在13 m以内,含13 m)的距离、NDVI(归一化植被指数)、植物群落(一级分类)的植被覆盖类型。

路宽窄的阈值选择13 m的理由是13 m的宽度包含2个车道或更宽,这个宽度对于动物穿越有较大的风险。降水量数据来自WorldClim(1 km×1 km(30弧秒)的分辨率)数据库,ESRI grid格式[14]。年降水量由一年中12个月的降水量的总和计算得到。最低温和最高温数据来自WorldClim数据库。年最低温和年最高温由计算得到。NDVI由红光波段与近红外波段计算得到,公式为:

NDVI = (NIR - RED) / (NIR + RED) (1)

式中,NIR、RED分别是近红外波段和红光波段的反射率。NDVI的值阈是-1到+1,负值表示缺少植被。所有不同来源的生境因子数据(见表2)都被储存在同一GIS环境中。由于日本重要景观要素的数据量较小,以及物种记录的高精度,所有生境因子被转换为50 m× 50 m的分辨率。运用软件Erdas Imagine? 8.7计算NDVI值,用ArcGIS? 9.3计算其他因子。用到的图象处理程序详见文献[6]

当运用ArcMap 9.3?为这320个带有环境变量的点制图时,发现有1个没有出现鬣羚的点位于研究区的外边。这个记录被删掉了,因此总记录为319个。根据鬣羚出没纪录的地理坐标,运用ArcMap 9.3?为每个鬣羚出没纪录点提取不同生境因子数据。

图3是JpSerow_env_FT数据生产的流程图。表3描述JpSerow_env_FT数据集各项的含义。表4提供表3中出现的植被代码[VEG]的含义。

JpSerow_env_FT数据生成的流程图

图3 JpSerow_env_FT数据生成的流程图

下载
表2 日本鬣羚的生境因子表
类别(来源)生境因子单位
地形(来自SRTM的DEM数据)
海拔高度m
坡度°
气候数据(WorldClim)
年平均降水量mm
年最低温
年最高温
水资源(数字化地图(1∶2.5万)、全球地图(100 m×100 m)日本1.0版)
到河流的距离m
道路(数字化地图1∶2.5万)到所有道路的距离m
类型
到高速公路的距离m
到普通道路的距离m
到小路和石砌台阶的距离m
宽度
到宽路的距离(路宽>13 m)m
到窄路的距离(路宽≤13 m)m
植被(Landsat-7 ETM+数据来自GLCF,用于计算NDVI;日本环境部的自然环境GIS数据集,用于提取植被覆盖)
NDVI(归一化植被指数)N/A
植被覆盖类型(植被群落一级)N/A
表3 JpSerow_env_FT属性数据字段定义、数据类型与精度表
属性字段字段定义(中文)数据类型数据精度
SPECIES物种的学名文本型-
XWGS84 UTM 54带X坐标数值型1 m
YWGS84 UTM 54带Y坐标数值型1 m
1 or 0出现或不出现的数据逻辑型-
AREA物种被观测到的地名文本型-
YEAR观测的年份文本型-
DEM海拔高度数值型1 m
SLOPE坡度数值型
PREP年平均降水量数值型1 mm
TMIN年最低温数值型1 ℃
TMAX年最高温数值型1 ℃

续表

属性字段字段定义(中文)数据类型数据精度
DIS_ROAD到所有道路的距离数值型1 m
HIGHWAY到高速公路的距离数值型1 m
NORMALROAD到普通道路的距离数值型1 m
SMALLSTREET到小路和石砌台阶的距离数值型1 m
WIDEROAD到宽路(路宽>13 m)的距离数值型1 m
NARROWROAD到窄路(路宽≤13 m)的距离数值型1 m
RIVER到河流的距离数值型1 m
NDVINDVI值数值型0.000,001
VEG植被覆盖类型文本型-
LATX坐标(日本大地基准面2000)数值型0.000,000,1度
LONGY坐标(日本大地基准面2000)数值型0.000,000,1度

*1 注释 1代表观测到,0代表没有观测到;*2 注释 植被覆盖类型用四位数字编码

表4 植被分类代码[VEG]及其对应的植被类型
植被分类代码[VEG]*1日本环境部植被制图图例系统(6类分类法)日本环境部植被制图图例系统(15类分类法)
2005亚高山带亚高山常绿针叶林带
2020亚高山带亚高山阔叶落叶林带
3008其他伐木林
4015山地森林带山地森林带阔叶落叶林
4024山地森林带山地森林带阔叶落叶林
4028山地森林带山地森林带阔叶落叶林
4030山地森林带山地森林带常绿针叶林
4093山地森林带山地森林带阔叶落叶林
4110山地森林带山地森林带阔叶落叶林
4132山地森林带山地森林带阔叶落叶林
5009山地森林带山地森林带阔叶落叶林
5020山地森林带山地森林带阔叶落叶林
5035山地森林带山地森林带阔叶落叶林
5042其他草地
5046其他草地
5049其他草地
5055其他草地
5066其他伐木林
6002低村庄低村庄常绿针叶林
6020低村庄低村庄阔叶常绿林
6039低村庄低村庄阔叶落叶林
6074低村庄低村庄阔叶常绿林

续表

植被分类代码[VEG]*1日本环境部植被制图图例系统(6类分类法)日本环境部植被制图图例系统(15类分类法)
6120低村庄低村庄阔叶落叶林
7002低村庄低村庄阔叶落叶林
7006低村庄低村庄阔叶落叶林
7011低村庄低村庄阔叶落叶林
7012低村庄低村庄阔叶落叶林
7013低村庄低村庄阔叶落叶林
7017低村庄低村庄阔叶常绿林
7036其他伐木林
7040其他伐木林
7054其他草地
7061其他草地
7069其他草地
7072其他已开发土地
7081低村庄低村庄常绿针叶林
7095其他干河床或裸地
8054其他草地
9006种植园种植常绿针叶林
9011种植园种植常绿针叶林
9013种植园种植常绿针叶林
9016种植园种植常绿针叶林
9023种植园种植针阔混交林
9055其他耕地
9062其他耕地
9064其他耕地
9066其他耕地
9068其他耕地
9070其他耕地
9072其他耕地
9082其他草地
9083其他草地
9095其他已开发土地
9098其他耕地
9902其他已开发土地
9905其他已开发土地
9915其他已开发土地
9919其他已开发土地
9931其他干河床或裸地
9933其他干河床或裸地

*1 注释 植被分类编码(四位)采用日本环境部制作的植被图标准分类图例(第2版-第5版)“MAJOR1”项[15]

图4为带有道路、边界和遥感影象的日本鬣羚记录图。图中所示的红三角和黄三角表示日本鬣羚的出没地点,是本文提供的数据集。其他项,如主要山脉、宽的道路、高速公路、边界、ESRI的遥感图象都不包括在本数据集内。

带有道路、边界和遥感影象的日本鬣羚记录图

图4 带有道路、边界和遥感影象的日本鬣羚记录图

下载

4 数据质量控制和验证

这个数据集已经被日本庆应义塾大学的有关研究人员验证过。日本鬣羚出现的地理信息系统数据集的均方根误差是251 m。

5 结论

日本珍稀物种日本鬣羚的出没地点及其生境因子数据集是研究日本鬣羚物种生息、繁衍的重要基础数据,是长时间序列监测该物种与其生境因子相互关系不可缺少的必要数据。该数据是在翔实调查基础上完成的,其中包括问卷调查、地理踏勘调查、与相关历史图鉴数据融合、历史文献记载融合、遥感影像数据融合等综合研究方式。该数据集可以为当地居民保护该物种、日本政府和县政府制定保护措施、以及全球生态环境保护战略在地方的落实等提供重要科学依据。

参考文献